中医学论文_肝细胞癌外周血单个核细胞关键基
文章摘要:目的 基于生物信息学的方法探索肝细胞癌外周血单个核细胞(peripheralbloodmononuclearcellsofhepatocellularcarcinoma,HCC-PBMC)的关键基因和潜在的治疗中药,并通过系统评价进一步确认该药的临床疗效。方法 利用基因表达数据库(geneexpressionomnibus,GEO)下载关于HCC-PBMC的芯片GSE58208和GSE36076。通过RStudio软件分析获得差异表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs)。利用STRING在线数据库进行蛋白-蛋白相互作用(protein-proteininteraction,PPI)分析,DAVID在线功能注释工具进行基因本体论(geneontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(kyotoencyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)富集分析。通过Cytoscape软件对HCC-PBMC差异基因进行可视化,同时,利用CytoHubba插件计算出HCC-PBMC的关键基因。通过将关键基因与医学信息检索平台(CoremineMedical)相互映射,筛选出治疗肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)的潜在中药并纳入下一步的系统评价。结果 共得出203个DEGs(上调基因194个,下调基因9个)。经DAVID分析,可知这些DEGs主要富集的生物学过程和信号通路包括:DNA模板转录调控、核糖核酸磷酸二酯键水解,核内裂解、核分裂的正调控、骨骼肌纤维发育、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)活性的激活、范可尼贫血途径、代谢途径。通过Cytoscape软件计算出HCC-PBMC的关键基因,分别是GTP酶,IMAP家族成员1(GIMAP1)、GTP酶,IMAP家族成员4(GIMAP4)、GTP酶,IMAP家族成员6(GIMAP6)、GTP酶,IMAP家族成员7(GIMAP7)、GTP酶,IMAP家族成员8(GIMAP8)、白细胞介素1β(IL-1β)、趋化因子(C-X3-C基元)受体1(CX3CR1)、趋化因子(C-C基元)受体2(CCR2)、Toll样受体7(TLR7)、表皮生长因子(EGF)。经CoremineMedical分析得出人参、姜黄、积雪草、白花蛇舌草与关键基因关系较为密切,其中人参具有补益肺脾、增强气力功效,与HCC肝郁脾虚、气阴两虚证相符合,故将以人参为君药的四君子汤纳入系统评价。经过评价得出人参在提高临床总体疗效,改善患者中医证候及血清CD4+、CD4+/CD8+水平,降低患者血清CD8+、TBIL水平方面均优于单纯西医治疗(P<0.01),且安全性高。结论 本研究基于基因层面展开分析,为临床工作者在诊断和治疗HCC方面提供了新思路,人参治疗HCC的系统评价为中医药临床防治HCC提供了依据。
文章关键词:肝细胞癌外周血单个核细胞,关键基因,中药,生信分析,系统评价,
项目基金:国家科技部重点研发计划项目(2018YFC1704102),河北省科技计划项目(21377724D,21377740D),文章来源:《中医杂志》 网址: http://www.zyzzzz.cn/qikandaodu/2021/0826/1678.html
上一篇:
中医学论文_中医药治疗脊髓损伤相关并发症的
下一篇:
中医学论文_基于数据挖掘分析清代胸痹症状及